抗凝血酶Ⅲ，是血漿中一種抗凝血酶，可抑制活化了的凝血因子Ⅹa、凝血因子Ⅱa（凝血酶）、凝血因子Ⅻa等，其中血漿中的凝血因子Ⅱa與凝血關系密切，凝血因子Ⅹa與血栓形成關系密切。
普通肝素、低分子肝素，與抗凝血酶Ⅲ結合后，可增加抗凝血酶Ⅲ與凝血因子Ⅹa的親和力，發揮抗凝血因子Ⅹa作用。但是，只有分子量較大的肝素（分子量＞5400KD），才能與抗凝血酶Ⅲ、凝血因子Ⅱa同時結合，發揮抗凝血因子Ⅱa作用。
抗凝血因子Ⅱa作用：抗凝作用普通肝素＞低分子肝素。
抗凝血因子Ⅹa作用：低分子肝素＞普通肝素。肝素的抗Ⅹa/Ⅱa比為1:1，低分子肝素該比為（2-4）:1。因此低分子肝素具有較強的抗血栓作用。
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